RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 CXorf38Q8TB03 319 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 SNX27Q96L92 541 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 ACCSQ96QU6 501 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 CWH43Q9H720 699 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 EXOC1Q9NV70 894 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.9□□□□□ -1.46
MSRA-208ENST00000522907 REV3LO60673 3130 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 LINC01553A4QN01 128 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ARL5CA6NH57 179 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 OGTO15294 1046 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 LPXNO60711 386 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 RECQL4O94761 1208 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 AMHP03971 560 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 STAG3L1P0CL83 205 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 KCNE1P15382 129 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 GARTP22102 1010 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 AKAP5P24588 427 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ABCD1P33897 745 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 TNFSF9P41273 254 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 KCNJ6P48051 423 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ZBTB6Q15916 424 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 NFIL3Q16649 462 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 KLHL40Q2TBA0 621 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SEZ6Q53EL9 994 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 C1orf220Q5T0J3 134 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ARTNQ5T4W7 220 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CENPPQ6IPU0 288 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 TTI2Q6NXR4 508 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 FAM35AQ86V20 835 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 NELFCDQ8IXH7 590 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 GPR152Q8TDT2 470 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 BORCS6Q96GS4 357 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 FAM84AQ96KN4 292 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 RAD9AQ99638 391 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 FUCA2Q9BTY2 467 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 TMEM117Q9H0C3 514 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 GBP3Q9H0R5 595 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SNTG2Q9NY99 539 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CNTN3Q9P232 1028 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 PTPRJQ12913 1337 aa5.89□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 F8W810 466 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 BIN1O00499 593 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 PDXKO00764 312 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CLDN3O15551 220 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 DDHD2O94830 711 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SMC2O95347 1197 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 MBD3O95983 291 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CA3P07451 260 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CLTAP09496 248 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CXCL8P10145 99 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 MPSTP25325 297 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 MLH1P40692 756 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CASP4P49662 377 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 LIG4P49917 911 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SCNN1GP51170 649 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 ERVK-21P61565 698 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 STRN3Q13033 797 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 MTMR3Q13615 1198 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 CAMK1Q14012 370 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 EDRF1Q3B7T1 1238 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 DPCR1Q3MIW9 517 aa5.88□□□□□ -1.47
MSRA-208ENST00000522907 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms