RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521220.1

CCDC25-208, Transcript of coiled-coil domain containing 25, human

TSL 2

Gene CCDC25, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC25-208	ENST00000521220	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PRKD3	O94806	890 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	RHO	P08100	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PCSK6	P29122	969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ERVK-21	P61565	698 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	UBR7	Q8N806	425 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PPP6C	O00743	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CBSL	P0DN79	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CBS	P35520	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	NDUFV1	P49821	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	GPR162	Q16538	588 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	WASF1	Q92558	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220		E9PLN8	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220		F5H697	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	MYO1F	O00160	1098 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PPEF2	O14830	753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	GPR39	O43194	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	EYA4	O95677	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TUBB4A	P04350	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	MCC	P23508	829 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC16A1	P53985	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	FHL1	Q13642	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	RGMA	Q96B86	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	REPS1	Q96D71	796 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	NTN1	O95631	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CHEK2	O96017	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	NDUFB7	P17568	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TLE1	Q04724	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TISP43	B9A030	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	MPG	P29372	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PLCD1	P51178	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC25-208	ENST00000521220	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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