RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
COPS5-208	ENST00000519057	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS5-208	ENST00000519057	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS5-208	ENST00000519057	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		5.78	□□□□□ -1.48
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0B4J269	797 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	GNAI3	P08754	354 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PIK3CG	P48736	1102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	GNAI1	P63096	354 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	NOG	Q13253	232 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TUBB3	Q13509	450 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	KLC4	Q9NSK0	619 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ORC4	O43929	436 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CHEK2	O96017	543 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	RARB	P10826	455 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PDC	P20941	246 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PHKA1	P46020	1223 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	NDUFV1	P49821	464 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	HK3	P52790	923 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	RFK	Q969G6	155 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	POLH	Q9Y253	713 aa		5.76	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SLC16A6	O15403	523 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	KIF20A	O95235	890 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	GPD1	P21695	349 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CCND1	P24385	295 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PCSK6	P29122	969 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM240	Q5SV17	173 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	USP45	Q70EL2	814 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	RGMA	Q96B86	450 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PBK	Q96KB5	322 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057		F5H697	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ARIH2	O95376	493 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CHRM3	P20309	590 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	MAP2K6	P52564	334 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SOX10	P56693	466 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	DPF1	Q92782	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ABCF2	Q9UG63	623 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	AOX1	Q06278	1338 aa		5.74	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TRIAP1	O43715	76 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	VPS4B	O75351	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	POU2F2	P09086	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CDK4	P11802	303 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	VPS53	Q5VIR6	699 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	CPA6	Q8N4T0	437 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	DKK3	Q9UBP4	350 aa		5.73	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	DTNB	O60941	627 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SOAT2	O75908	522 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	AHSG	P02765	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	TYR	P14679	529 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	USP37	Q86T82	979 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	FKBP10	Q96AY3	582 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	HAPLN3	Q96S86	360 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	SERHL	Q9NQF3	203 aa		5.72	□□□□□ -1.49
COPS5-208	ENST00000519057	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49

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