RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		26.02	■■□□□ 1.76
CNOT7-204	ENST00000518885	MTMR11	A4FU01	709 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TECTA	O75443	2155 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	WNT7B	P56706	349 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	STK4	Q13043	487 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	DUSP4	Q13115	394 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	WSCD1	Q658N2	575 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CENPP	Q6IPU0	288 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	RDH13	Q8NBN7	331 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		26.01	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF202	O95125	648 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	NUBP1	P53384	320 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CYP24A1	Q07973	514 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	VEPH1	Q14D04	833 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	DPH6	Q7L8W6	267 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	BORCS6	Q96GS4	357 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CGRRF1	Q99675	332 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	WNT16	Q9UBV4	365 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		26	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PDXK	O00764	312 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	LHX1	P48742	406 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	AP3M2	P53677	418 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM122A	Q96E09	287 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	HPDL	Q96IR7	371 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	ACBD6	Q9BR61	282 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	GPR88	Q9GZN0	384 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		25.99	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	RHOBTB3	O94955	611 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	RFX1	P22670	979 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PCSK1	P29120	753 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	ING5	Q8WYH8	240 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP72	Q9P209	647 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		25.98	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	MYL4	P12829	197 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	EPHA5	P54756	1037 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	DPYD	Q12882	1025 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	KCNB1	Q14721	858 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TAF12	Q16514	161 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	CXorf38	Q8TB03	319 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	RMND1	Q9NWS8	449 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SIX4	Q9UIU6	781 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	L1RE1	Q9UN81	338 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TSC2	P49815	1807 aa		25.97	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TCHH	Q07283	1943 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	ECI2	O75521	394 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PFKP	Q01813	784 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TRPC3	Q13507	836 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PARM1	Q6UWI2	310 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	FGF14	Q92915	247 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM209	Q96SK2	561 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	SCN1A	P35498	2009 aa		25.96	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	PTPRJ	Q12913	1337 aa		25.95	■■□□□ 1.75
CNOT7-204	ENST00000518885	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	PHACTR2	O75167	634 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	VNN2	O95498	520 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	CFH	P08603	1231 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	CEBPB	P17676	345 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	CLCN5	P51795	746 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	SIX5	Q8N196	739 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	PSMG2	Q969U7	264 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	GCNA	Q96QF7	691 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		25.95	■■□□□ 1.74
CNOT7-204	ENST00000518885	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	25.95	■■□□□ 1.74

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