RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC16A1P53985 500 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 AWAT2Q6E213 333 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCAMP4Q969E2 229 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 HDAC10Q969S8 669 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIB1Q96RU8 372 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NELL2Q99435 816 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM75PA6NK02 468 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 F5H697 171 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NTN1O95631 604 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM163BP0C2L3 166 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNHG28P0DPA3 235 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITGALP20701 1170 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALDH9A1P49189 494 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GADL1Q6ZQY3 521 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GALNT16Q8N428 558 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFI44Q8TCB0 444 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHAC2Q8WUX2 184 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMX3Q96JJ7 454 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNPPD1Q9BV87 410 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS22Q9GZN4 317 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMX1Q9H3N1 280 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 WWOXQ9NZC7 414 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 VWC2LB2RUY7 222 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TLR5O60602 858 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GNAI3P08754 354 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 OSMP13725 252 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP2C19P33261 490 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NR4A2P43354 598 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GNAI1P63096 354 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MC2RQ01718 297 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 STAT4Q14765 748 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF66Q6ZN08 573 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FANCBQ8NB91 859 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMIEQ8NEW7 156 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM136AQ96C01 138 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 VPS16Q9H269 839 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ELOVL5Q9NYP7 299 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CFAP97Q9P2B7 532 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF580Q9UK33 172 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TISP43B9A030 160 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRRT4C9JH25 899 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SOCS2O14508 198 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADAMTS3O15072 1205 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FTH1P19P0C7X4 201 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCF15Q12870 199 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MIDNQ504T8 468 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 JAZF1Q86VZ6 243 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CMIPQ8IY22 773 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM109AQ8N4B1 249 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC17A8Q8NDX2 589 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NRG4Q8WWG1 115 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 REPS1Q96D71 796 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACTRT3Q9BYD9 372 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR35Q9HC97 309 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SH3BP4Q9P0V3 963 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 INTUQ9ULD6 942 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 H7C1Q1 480 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 QSOX1O00391 747 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR39O43194 453 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms