RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GUA9	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRG1	O14668	218 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A4	O14863	429 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC45	O75419	566 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RET	P07949	1114 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RHO	P08100	348 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	POU2F2	P09086	479 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LIG1	P18858	919 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB33A	Q14088	237 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	IL31	Q6EBC2	164 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SNTG2	Q9NY99	539 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	HCN2	Q9UL51	889 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX3	O15119	743 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GAT3	O94766	335 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPB	P17676	345 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN2	P17706	415 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	XBP1	P17861	261 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TGM1	P22735	817 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRA2	P23416	452 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL12	P48061	93 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPP19	P56211	112 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RTL10	Q7L3V2	364 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM3C	Q92520	227 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CORO1B	Q9BR76	489 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF197	O14709	1029 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	N4BP3	O15049	544 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP3	O75074	770 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RECQL4	O94761	1208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB42	P16452	691 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GDI1	P31150	447 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL2	P36404	184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	STK3	Q13188	491 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP68	Q76N32	757 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	HAS1	Q92839	578 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GDA	Q9Y2T3	454 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGES	O14684	152 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SLITRK3	O94933	977 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	EPX	P11678	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CSRP2	Q16527	193 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCE	Q6IPM2	695 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5

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