RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 SQSTM1Q13501 440 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MORC3Q14149 939 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GIT2Q14161 759 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 PLCB4Q15147 1175 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 C4orf19Q8IY42 314 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 IQUBQ8NA54 791 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CNNM3Q8NE01 707 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CDHR1Q96JP9 859 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATA33Q96N06 139 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SDF4Q9BRK5 362 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GRIN2DO15399 1336 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 FSD2A1L4K1 749 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 AP5Z1O43299 807 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC26A4O43511 780 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 KINO60870 393 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS4O75173 837 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF205O95201 554 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MED26O95402 600 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 PGK1P00558 417 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GH1P01241 217 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 LGALS2P05162 132 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MMP3P08254 477 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM153BP0C7A2 387 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF286BP0CG31 522 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 FGFR1P11362 822 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 PTMSP20962 102 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SFNP31947 248 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 HOXD13P35453 343 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GRIK1P39086 918 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CASP5P51878 434 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKCEQ02156 737 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 STK4Q13043 487 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 DRP2Q13474 957 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 NEDD9Q14511 834 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SDE2Q6IQ49 451 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GPBP1Q86WP2 473 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 DTX1Q86Y01 620 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 RDM1Q8NG50 284 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 PPTC7Q8NI37 304 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ASB11Q8WXH4 323 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 UBE2FQ969M7 185 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CALML4Q96GE6 196 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ERO1AQ96HE7 468 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 TNMDQ9H2S6 317 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GDAQ9Y2T3 454 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM17Q9Y577 477 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MCM3APO60318 1980 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 EMSYQ7Z589 1322 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 HAS3O00219 553 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAM23O75077 832 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 SCG5P05408 212 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MUTP22033 750 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 MARK3P27448 753 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GRIA2P42262 883 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 STAT5BP51692 787 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 LBX1P52954 281 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GJA9P57773 515 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 IQCB1Q15051 598 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 LRRC41Q15345 812 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-212ENST00000491266 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms