RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PJA1Q8NG27 643 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKS1AQ92625 1134 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SCAMP4Q969E2 229 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR35Q9HC97 309 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SRRDQ9UH36 339 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 IQGAP2Q13576 1575 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPRGP23470 1445 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GTW7 788 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MYO1FO00160 1098 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 FRS3O43559 492 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJB5O75953 348 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 NCR1O76036 304 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 UNC5CO95185 931 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF20AO95235 890 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MYL3P08590 195 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA31D3P0C874 917 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MYF5P13349 255 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC5A1P13866 664 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 BRAFP15056 766 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 NR4A1P22736 598 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 NEK3P51956 506 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 DGCR2P98153 550 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 IL31Q6EBC2 164 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 USP37Q86T82 979 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PNKPQ96T60 521 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CHST12Q9NRB3 414 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MED16Q9Y2X0 877 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 UGGT2Q9NYU1 1516 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 UACAQ9BZF9 1416 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RICTORQ6R327 1708 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS4BO75351 444 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFPL1O95159 310 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD16AO95870 558 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 GPANK1O95872 356 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CHEK2O96017 543 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PHKG2P15735 406 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CHRM3P20309 590 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ARFIP2P53365 341 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRED1Q7Z699 444 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF276Q8N554 614 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MAML1Q92585 1016 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 APIPQ96GX9 242 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 STK32BQ9NY57 414 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ETAA1Q9NY74 926 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR7Q9Y4E6 1490 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 BTN3A1O00481 513 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PLIN1O60240 522 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA10O95299 355 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CFIP05156 583 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 GRPP07492 148 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MC2RQ01718 297 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PIGFQ07326 219 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF844Q08AG5 666 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC13A2Q13183 592 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CNGA2Q16280 664 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms