RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 LEMD2Q8NC56 503 aa20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.05■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 PAX3P23760 479 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 GDI1P31150 447 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 METTL23Q86XA0 190 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 BCO2Q9BYV7 579 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 DSEQ9UL01 958 aa20.04■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 F5P12259 2224 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 KPNA7A9QM74 516 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 PSMC3P17980 439 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 GAREM2Q75VX8 874 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 ADSSL1Q8N142 457 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 PSMG2Q969U7 264 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.03■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 ITGB3P05106 788 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 GARTP22102 1010 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 E2F4Q16254 413 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 SV2CQ496J9 727 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 GIPC2Q8TF65 315 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 DNASE1L2Q92874 299 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 SNX21Q969T3 373 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 DHX58Q96C10 678 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CLK1-211ENST00000481641 PPP6R2O75170 966 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ATF6P18850 670 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 GABRR2P28476 465 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 FZD5Q13467 585 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ALCAMQ13740 583 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 SHC4Q6S5L8 630 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ASB3Q9Y575 518 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 PATJQ8NI35 1801 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 COL4A2P08572 1712 aa20.01■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ZNF263O14978 683 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 EXTL3O43909 919 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 CYP4F8P98187 520 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 BFSP1Q12934 665 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 GPR158Q5T848 1215 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 STKLD1Q8NE28 680 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 CXorf38Q8TB03 319 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 IRF7Q92985 503 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 CLDN23Q96B33 292 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ZNF560Q96MR9 790 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 LRRC3BQ96PB8 259 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 TRIM9Q9C026 710 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 GPR88Q9GZN0 384 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 TNMDQ9H2S6 317 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 TMEM206Q9H813 350 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 HSFX1Q9UBD0 423 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 L1RE1Q9UN81 338 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 FANCMQ8IYD8 2048 aa19.99■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 LAMTOR5O43504 91 aa19.99■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 CUTAO60888 179 aa19.99■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 KRT19P08727 400 aa19.99■□□□□ 0.79
CLK1-211ENST00000481641 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms