RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 PHACTR2O75167 634 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ALADP13716 330 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 BIRC3Q13489 604 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 TRPC3Q13507 836 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 STIM1Q13586 685 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 TSG101Q99816 390 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 MTMR11A4FU01 709 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 AKAP3O75969 853 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 DLG4P78352 724 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 CLDN10P78369 228 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ADAM9Q13443 819 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ISM2Q6H9L7 571 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 TMC2Q8TDI7 906 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 YIPF1Q9Y548 306 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 PTPRDP23468 1912 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 CLSTN1O94985 981 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 FSHRP23945 695 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 NTHL1P78549 312 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 MYL7Q01449 175 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 TSPY1Q01534 308 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 ELMOD1Q8N336 334 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 SPATA18Q8TC71 538 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NELFE-208ENST00000481121 VNN2O95498 520 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 KRT13P13646 458 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R2P41236 205 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 VAMP7P51809 220 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TWF1Q12792 350 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 DUSP4Q13115 394 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CENPPQ6IPU0 288 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 DPH6Q7L8W6 267 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ADSSL1Q8N142 457 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MMS19Q96T76 1030 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.32■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PSMA7O14818 248 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TNNC1P63316 161 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 LRRC63Q05C16 580 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PLD1Q13393 1074 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 BIN1O00499 593 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 IKBKBO14920 756 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CETN3O15182 167 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PTPN2P17706 415 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ATICP31939 592 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 LHX1P48742 406 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MYL6P60660 151 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SMARCB1Q12824 385 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 NCOA4Q13772 614 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 PTPN21Q16825 1174 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF699Q32M78 642 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 GBP4Q96PP9 640 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MYADMQ96S97 322 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ACBD6Q9BR61 282 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ENPEPQ07075 957 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 MORC3Q14149 939 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CAMK4Q16566 473 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ZACNQ401N2 412 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 IQCEQ6IPM2 695 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 OSTM1Q86WC4 334 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 CORO1BQ9BR76 489 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-208ENST00000481121 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.3■■□□□ 1.16
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