RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	CASP4	P49662	377 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ING5	Q8WYH8	240 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM221	A6NGB7	291 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089		M0R296	226 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF20A	O95235	890 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPN2	P17706	415 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CENPP	Q6IPU0	288 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF516	Q92618	1163 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	HPDL	Q96IR7	371 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP72	Q9P209	647 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		31.5	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	MYO1E	Q12965	1108 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ELMOD1	Q8N336	334 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	FGF13	Q92913	245 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CDH7	Q9ULB5	785 aa		31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	COL9A1	P20849	921 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP135	Q66GS9	1140 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		31.48	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SOAT2	O75908	522 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TDG	Q13569	410 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	OSTM1	Q86WC4	334 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		31.47	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	IQCE	Q6IPM2	695 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ASIC4	Q96FT7	647 aa		31.46	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	HCRT	O43612	131 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	CEBPB	P17676	345 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ALDH1A3	P47895	512 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TIGD1	Q96MW7	591 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	RMND1	Q9NWS8	449 aa		31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
FBXO18-208	ENST00000470089	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	NR2F2	P24468	414 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	CCR2	P41597	374 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	TSPY1	Q01534	308 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PLD1	Q13393	1074 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	HTR4	Q13639	388 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		31.44	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PHACTR2	O75167	634 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MYL4	P12829	197 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	EPHB3	P54753	998 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	DLG4	P78352	724 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MYL7	Q01449	175 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	TRPC3	Q13507	836 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	PARM1	Q6UWI2	310 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SMARCE1	Q969G3	411 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MMS19	Q96T76	1030 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	ANHX	E9PGG2	379 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	SMC2	O95347	1197 aa		31.42	■■■□□ 2.62
FBXO18-208	ENST00000470089	MYL6	P60660	151 aa		31.42	■■■□□ 2.62

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