RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 CEP95Q96GE4 821 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDIP1Q9H305 208 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ACAD9Q9H845 621 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 NYAP2Q9P242 653 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 FEM1BQ9UK73 627 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MYH8P13535 1937 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIF28PB7ZC32 967 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC27A2O14975 620 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF20P17024 532 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCNA5P22460 613 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MCCP23508 829 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MRE11P49959 708 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 DDR2Q16832 855 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 NSMFQ6X4W1 530 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 DCAF4Q8WV16 495 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PRODHO43272 600 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 LPXNO60711 386 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 APPP05067 770 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PFKMP08237 780 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 IQCF3P0C7M6 154 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ATP5JP18859 108 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 TDO2P48775 406 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 STAT2P52630 851 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 OAZ1P54368 228 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 GRIN1Q05586 938 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBE3CQ15386 1083 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 VASNQ6EMK4 673 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCTD1Q719H9 257 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MBD6Q96DN6 1003 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 JADE2Q9NQC1 790 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS6KC1-203ENST00000468069 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 TTLL1O95922 423 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 TSPY3P0CV98 308 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 TSPY8P0CW00 308 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 FGFR1P11362 822 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 IL9P15248 144 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 RFC2P35250 354 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC1A4P43007 532 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 CPT1AP50416 773 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 PPP2CBP62714 309 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 PPP2CAP67775 309 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 DEFB103AP81534 67 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 NHLH1Q02575 133 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 NFATC3Q12968 1075 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 KIZQ2M2Z5 673 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 SBK1Q52WX2 424 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms