RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	FSIP1	Q8NA03	581 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	B3GALT6	Q96L58	329 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	BRD9	Q9H8M2	597 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	TSC2	P49815	1807 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-223	ENST00000466245	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	EXTL3	O43909	919 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	B3GAT3	O94766	335 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CXCL8	P10145	99 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CNR2	P34972	360 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXD13	P35453	343 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	OSTN	P61366	133 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NTHL1	P78549	312 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNA1	Q09470	495 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MTAP	Q13126	283 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CUL4B	Q13620	913 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNB1	Q14721	858 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CSRP2	Q16527	193 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	IRF7	Q92985	503 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN1A	P35498	2009 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ATRX	P46100	2492 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF202	O95125	648 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF20A	O95235	890 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LRG1	P02750	347 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ELF1	P32519	619 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TNFSF9	P41273	254 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CLCNKB	P51801	687 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC32	Q14392	662 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SURF1	Q15526	300 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LPAL2	Q16609	132 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MSANTD3	Q96H12	275 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TISP43	B9A030	160 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245		M0QZQ0	153 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PODXL	O00592	558 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PDXK	O00764	312 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF197	O14709	1029 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TGM1	P22735	817 aa		10.87	□□□□□ -0.67

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