RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 RARBP10826 455 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CERKQ8TCT0 537 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC5A5Q92911 643 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PROSCO94903 275 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CD4P01730 458 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 EML1O00423 815 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ITGB3P05106 788 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 VCAM1P19320 739 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 IL1RL1Q01638 556 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KDSRQ06136 332 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SPATA20Q8TB22 786 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CENPKQ9BS16 269 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CGRRF1Q99675 332 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 A0A0U1RQJ8 604 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FUT2Q10981 343 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 FAM83AQ86UY5 434 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TRIM15Q9C019 465 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZBTB22O15209 634 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 APOEP02649 317 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ACADSBP45954 432 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SP110Q9HB58 689 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.072e-8■□□□□ 10.2
PTPRU-205ENST00000460170 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 AP3B1O00203 1094 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DFFAO00273 331 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJC3Q13217 504 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SNAPC2Q13487 334 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MIIPQ5JXC2 388 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 WDR59Q6PJI9 974 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 HAS1Q92839 578 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RFX8Q6ZV50 586 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 AGR3Q8TD06 166 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TSC22D3Q99576 134 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ERVK-9P63128 1117 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 C4orf22Q6V702 233 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 LONP2Q86WA8 852 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 IFT172Q9UG01 1749 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FGRP09769 529 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 LAMC2Q13753 1193 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HIC1Q14526 733 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RNF135Q8IUD6 432 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EXD1Q8NHP7 514 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CYP3A4P08684 503 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MCL1Q07820 350 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 DACT2Q5SW24 774 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 AFG1LQ8WV93 481 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC138Q96M89 665 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FGD4Q96M96 766 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ADA2Q9NZK5 511 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MAP2K7O14733 419 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SNX2O60749 519 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SERPINB4P48594 390 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PDK1Q15118 436 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PGM5Q15124 567 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms