RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSSK4Q6SA08 328 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYMQ7RTS9 669 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD302Q8IX05 232 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEMD2Q8NC56 503 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM212AQ96EL1 285 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP28Q96RU2 1077 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCO2Q9BYV7 579 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRDQ9H2X0 955 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB7Q9H672 318 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRD9Q9H8M2 597 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASAH2Q9NR71 780 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 DERAQ9Y315 318 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2CD2Q9Y426 696 aa9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPRP12270 2363 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMTOR5O43504 91 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNB1P11230 501 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ODC1P11926 461 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT1P21579 422 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXC13P31276 330 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA9P43362 315 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTAPQ13126 283 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC142Q17RM4 750 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADALQ6DHV7 355 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCEQ6IPM2 695 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIN3Q8TB24 985 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMG2Q969U7 264 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 RMDN1Q96DB5 314 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHFRQ96EP1 664 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK17AQ9UEE5 414 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTMR6Q9Y217 621 aa9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPRJQ12913 1337 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRAMEF12O95522 483 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGM1P22735 817 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABRR2P28476 465 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ID4P47928 161 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX9P48436 509 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF6P49848 677 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP4F8P98187 520 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 WSCD1Q658N2 575 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP37Q86T82 979 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELMOD1Q8N336 334 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 STKLD1Q8NE28 680 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRF7Q92985 503 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 HVCN1Q96D96 273 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NELL2Q99435 816 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKMYT1Q99640 499 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPP3Q9NY33 737 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMA1P25391 3075 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYB561D2O14569 222 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHADO15335 359 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms