RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SV2AQ7L0J3 742 aa18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP63Q96MT8 703 aa18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 L1RE1Q9UN81 338 aa18.11■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 CPB1P15086 417 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 BIRC3Q13489 604 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 NCOA4Q13772 614 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TTI2Q6NXR4 508 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 GJD3Q8N144 294 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 MLKLQ8NB16 471 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 NELFBQ8WX92 580 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ACBD6Q9BR61 282 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 POMKQ9H5K3 350 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 USTQ9Y2C2 406 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 PLXNA3P51805 1871 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 STX10O60499 249 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 XYLBO75191 536 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TACC1O75410 805 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC24AO95486 1093 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 WEE2P0C1S8 567 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 MYL6P60660 151 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 MYL7Q01449 175 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ADCY1Q08828 1119 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 GPT2Q8TD30 523 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF4BQ92750 862 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 PIDD1Q9HB75 910 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 CDH22Q9UJ99 828 aa18.09■□□□□ 0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 DLL1O00548 723 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 PRRG1O14668 218 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 VNN1O95497 513 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4Q2P0C623 313 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP3CAQ08209 521 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 PAK1Q13153 545 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR72Q3MJ13 1102 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM209Q96SK2 561 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 NR2E1Q9Y466 385 aa18.08■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF10AO00220 468 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 VNN2O95498 520 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 PCSK1P29120 753 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TNNC1P63316 161 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPY1Q01534 308 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 MMS19Q96T76 1030 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 CD320Q9NPF0 282 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 RWDD2AQ9UIY3 292 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 MTMR11A4FU01 709 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 GNA14O95837 355 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD3O95983 291 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 LRG1P02750 347 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM49P0CI25 452 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM49CP0CI26 452 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 GCLMP48507 274 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP4Q13115 394 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF699Q32M78 642 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT39Q6A163 491 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 OSTM1Q86WC4 334 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms