RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLC1Q07866 573 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MTMR1Q13613 665 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM270Q6UE05 265 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NLRX1Q86UT6 975 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OGFOD1Q8N543 542 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMC2Q8TDI7 906 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXO41Q8TF61 875 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TSC22D3Q99576 134 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CYLDQ9NQC7 956 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KANSL3Q9P2N6 904 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HEY2Q9UBP5 337 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KRT36O76013 467 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LMNB2Q03252 620 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CENPUQ71F23 418 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CPXCR1Q8N123 301 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ALLCQ8N6M5 410 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PIDD1Q9HB75 910 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RFC5P40937 340 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GPX6P59796 221 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DYNLT1P63172 113 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WDR44Q5JSH3 913 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GPD1LQ8N335 351 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLRN2A0PK11 232 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATP9AO75110 1047 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HLA-DRAP01903 254 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ACADSP16219 412 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GNA15P30679 374 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WNT7BP56706 349 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NOMO3P69849 1222 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZBTB16Q05516 673 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RFX8Q6ZV50 586 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP37Q86T82 979 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC6Q86X45 466 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PTPRN2Q92932 1015 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATP2A1O14983 1001 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ALOX15BO15296 676 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ECE2O60344 883 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HAUS5O94927 633 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GNAT1P11488 350 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ERFP50548 548 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BIRC2Q13490 618 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SH3GL3Q99963 347 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STOML1Q9UBI4 398 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLX4Q8IY92 1834 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZBED4O75132 1171 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TJP3O95049 919 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NEFHP12036 1026 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GLRA2P23416 452 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC18A1P54219 525 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RCN2Q14257 317 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MORF4L2Q15014 288 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HIF1AQ16665 826 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AOC3Q16853 763 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF677Q86XU0 584 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TEKT4Q8WW24 435 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLUHO75153 1309 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 F8VP50 259 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GYG2O15488 501 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZWINTO95229 277 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SERPINB3P29508 390 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ACOT2P49753 483 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms