RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.34□□□□□ -1.23
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CCL20-202ENST00000409189 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 HOMER1Q86YM7 354 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 RARBP10826 455 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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CCL20-202ENST00000409189 SLC1A4P43007 532 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ID4P47928 161 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 ADCY7P51828 1080 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 PRR5P85299 388 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 EFEMP1Q12805 493 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 SCN5AQ14524 2016 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL20-202ENST00000409189 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
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