RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 INCA1Q0VD86 236 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 PASD1Q8IV76 773 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 WHAMMQ8TF30 809 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 DNAI1Q9UI46 699 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 TIMP1P01033 207 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 TUBB4AP04350 444 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 GZMAP12544 262 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 IKBKEQ14164 716 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 UPP1Q16831 310 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 DPH6Q7L8W6 267 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 UROC1Q96N76 676 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 SNX25Q9H3E2 840 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 INTUQ9ULD6 942 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-204ENST00000402096 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CYB561D2O14569 222 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 MED7O43513 233 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CFHP08603 1231 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TFAP2BQ92481 460 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 L1RE1Q9UN81 338 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 MYH10P35580 1976 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 A8MXQ7 604 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0355O15063 1070 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ISCUQ9H1K1 167 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ATP8B3O60423 1300 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ALPK3Q96L96 1907 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD62A6NC57 917 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 HOXA2O43364 376 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 BUB1O43683 1085 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TACC1O75410 805 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 B3GAT3O94766 335 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 MOCS3O95396 460 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ITGB8P26012 769 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 NAA35Q5VZE5 725 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 HASPINQ8TF76 798 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 SENP8Q96LD8 212 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 WDR24Q96S15 920 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 THAP2Q9H0W7 228 aa21.81■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 DDHD2O94830 711 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM253P0C7T8 217 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 VDRP11473 427 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CSF2RAP15509 400 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CASQ1P31415 396 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 GATMP50440 423 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 SGO2Q562F6 1265 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 ACOT1Q86TX2 421 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 UNC93AQ86WB7 457 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 SLC35F6Q8N357 371 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM199Q8N511 208 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 KIF18AQ8NI77 898 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 CEP83Q9Y592 693 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 UPP2O95045 317 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 PDGFRBP09619 1106 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 NOX5Q96PH1 765 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 LTBP2Q14767 1821 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 OR1G1P47890 313 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 NOMO3P69849 1222 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 WSCD1Q658N2 575 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-204ENST00000402096 MFSD5Q6N075 450 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms