RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NYAP2Q9P242 653 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K13O43283 966 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CAND2O75155 1236 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MTMR1Q13613 665 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UGP2Q16851 508 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EFHC2Q5JST6 749 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TTLL6Q8N841 843 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 KCNK16Q96T55 309 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CCT7Q99832 543 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LXNQ9BS40 222 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PPCSQ9HAB8 311 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PARVBQ9HBI1 364 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 AKAP10O43572 662 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ATP9BO43861 1147 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PAX7P23759 505 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FMO5P49326 533 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 VEPH1Q14D04 833 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 INPP5DQ92835 1189 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 MST1RQ04912 1400 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 E2F8A0AVK6 867 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RASSF9O75901 435 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ACADSP16219 412 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EPHA7Q15375 998 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 VPS72Q15906 364 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MFN1Q8IWA4 741 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.27□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
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PTPRM-202ENST00000400053 STK25O00506 426 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 GLI1P08151 1106 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2ADP20671 130 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 PID1Q7Z2X4 250 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 PTK7Q13308 1070 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 STXBP2Q15833 593 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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