RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 AOX1Q06278 1338 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF785A8K8V0 405 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIAP1O43715 76 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 KATNA1O75449 491 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARIH2O95376 493 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRKCGP05129 697 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCSK6P29122 969 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITKQ08881 620 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIF22Q14807 665 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 DPF1Q92782 380 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFKQ969G6 155 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 HAPLN3Q96S86 360 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 BRD9Q9H8M2 597 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLHQ9Y253 713 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01548A6NM66 108 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALG1L2C9J202 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC16A6O15403 523 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTLL1O95922 423 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 GJB1P08034 283 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHOP08100 348 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RARBP10826 455 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 DRD4P21917 467 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRDX5P30044 214 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABCG1P45844 678 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIK3CGP48736 1102 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ODF1Q14990 250 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM153CQ494X1 144 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 C3orf20Q8ND61 904 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FBXO41Q8TF61 875 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FKBP10Q96AY3 582 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIK2Q9H0K1 926 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDCPQ9H6R7 721 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 EHD3Q9NZN3 535 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF7Q9UBF6 113 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNKSO95271 1327 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 F5H697 171 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 DTNBO60941 627 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CELA2AP08217 269 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGALP20701 1170 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMARCA1P28370 1054 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMPD3Q01432 767 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPN21Q16825 1174 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIER2Q8N344 545 aa3.54□□□□□ -1.84
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR26Q9H7D7 661 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 AGAP1Q9UPQ3 857 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 NXPH3O95157 252 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIF20AO95235 890 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 NR2F6P10588 404 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD6P30203 668 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCT8P50990 548 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF81P51508 661 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 HK3P52790 923 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-601P-201ENST00000384540 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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