RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 HCRTO43612 131 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SOD2P04179 222 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LMO2P25791 158 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 INCA1Q0VD86 236 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 RTP2Q5QGT7 225 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 METTL23Q86XA0 190 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SPC24Q8NBT2 197 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 WHAMMQ8TF30 809 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 IQCDQ96DY2 449 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 CERS4Q9HA82 394 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 CHST7Q9NS84 486 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.05■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 CILPO75339 1184 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 TRIM14Q14142 442 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 USP41Q3LFD5 358 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 VPS52Q8N1B4 723 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 TIFAQ96CG3 184 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SPAG5Q96R06 1193 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 TTPALQ9BTX7 342 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SNX25Q9H3E2 840 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LAMA3Q16787 3333 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 F8VZ95 297 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 OAZ2O95190 189 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PDGFRBP09619 1106 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 NDST1P52848 882 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ZNF394Q53GI3 561 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 TMEM270Q6UE05 265 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SPATA18Q8TC71 538 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 TWNKQ96RR1 684 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 DNAJB1P25685 340 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 USP8P40818 1118 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LHX1P48742 406 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ZBED6P86452 979 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PDXDC1Q6P996 788 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LZTS1Q9Y250 596 aa22.03■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LRRC53A6NM62 1247 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 A8MXQ7 604 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 GRM6O15303 877 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 KRT5P13647 590 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 KRT9P35527 623 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 SOX5P35711 763 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 STAT1P42224 750 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 RAD23BP54727 409 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 ORC1Q13415 861 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 UNC93AQ86WB7 457 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 TTC39CQ8N584 583 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 POF1BQ8WVV4 589 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 MYO6Q9UM54 1294 aa22.02■■□□□ 1.12
NELFE-202ENST00000375429 H3BNC9 293 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 CYP26A1O43174 497 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 DSG1Q02413 1049 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 ZBP1Q9H171 429 aa22.01■■□□□ 1.11
NELFE-202ENST00000375429 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms