RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 FGFR3P22607 806 aa31.62■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 MSNP26038 577 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 USP41Q3LFD5 358 aa31.62■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRF2Q8IZF7 708 aa31.62■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 ARNTL2Q8WYA1 636 aa31.62■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 KREMEN1Q96MU8 473 aa31.62■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC12Q9UKB3 198 aa31.62■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 VPS52Q8N1B4 723 aa31.61■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa31.61■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa31.61■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 TTPALQ9BTX7 342 aa31.6■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 CHST7Q9NS84 486 aa31.6■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 LZTS1Q9Y250 596 aa31.6■■■□□ 2.65
ECHS1-201ENST00000368547 H3BNC9 293 aa31.59■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 CISHQ9NSE2 258 aa31.59■■■□□ 2.65
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF576Q9H609 170 aa31.57■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 EPOPA6NHQ4 379 aa31.56■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD10Q9NUJ1 306 aa31.56■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 HCRTO43612 131 aa31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 CSPG5O95196 566 aa31.55■■■□□ 2.64
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