RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-202ENST00000367364 JKAMPQ9P055 326 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-202ENST00000367364 SOCS2O14508 198 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 BMPR2Q13873 1038 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 POC1BQ8TC44 478 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 USP7Q93009 1102 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 DNM3Q9UQ16 869 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087X0B3 334 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 E9PLN8 166 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SLC43A1O75387 559 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 FAM163BP0C2L3 166 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 PIGFQ07326 219 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 DHCR24Q15392 516 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF365Q70YC5 407 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 CNGA4Q8IV77 575 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 FANCBQ8NB91 859 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 DPF2Q92785 391 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 RAB24Q969Q5 203 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 C5orf34Q96MH7 638 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TRIB1Q96RU8 372 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 IFT22Q9H7X7 185 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 VTA1Q9NP79 307 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 FANCLQ9NW38 375 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 E5RJQ4 531 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 F5H697 171 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 H0YIZ8 118 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 BCAR3O75815 825 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFB7P17568 137 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SCAND1P57086 179 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TBCCQ15814 346 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 CHSY1Q86X52 802 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 E9PSI1 815 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 OSMP13725 252 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 MTNR1BP49286 362 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFV1P49821 464 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 APPBP2Q92624 585 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 PLAAQ9Y263 795 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ZEB2O60315 1214 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 GPR3P46089 330 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SLC5A3P53794 718 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TRIAP1O43715 76 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 PDE8AO60658 829 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 THBS3P49746 956 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 KRT78Q8N1N4 520 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 IFI44Q8TCB0 444 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 TMX3Q96JJ7 454 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SMOQ99835 787 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SERHLQ9NQF3 203 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-202ENST00000367364 NXPH3O95157 252 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 TTC1Q99614 292 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 PDHA1P08559 390 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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