RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CBX3Q13185 183 aa22.89■■□□□ 1.26
OPN3-201ENST00000366554 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.89■■□□□ 1.26
OPN3-201ENST00000366554 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
OPN3-201ENST00000366554 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.89■■□□□ 1.26
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
OPN3-201ENST00000366554 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.89■■□□□ 1.26
OPN3-201ENST00000366554 S100A14Q9HCY8 104 aa22.89■■□□□ 1.26
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OPN3-201ENST00000366554 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.89■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 MZB1Q8WU39 189 aa22.89■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.88■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.88■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.88■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.87■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 USP17L11C9JVI0 530 aa22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 USP17L22D6RA61 530 aa22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 USP17L19D6RCP7 530 aa22.87■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 USP17L20D6RJB6 530 aa22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 USP17L24Q0WX57 530 aa22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.87■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 FETUBQ9UGM5 382 aa22.87■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 EMSYQ7Z589 1322 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 CYP4A11Q02928 519 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 EPC2Q52LR7 807 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 LPCAT4Q643R3 524 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 RDH13Q8NBN7 331 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 MAML3Q96JK9 1138 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 NHSQ6T4R5 1651 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 ETV4P43268 484 aa22.86■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 MMEL1Q495T6 779 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.86■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP4P98171 946 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 PPP3CAQ08209 521 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.85■■□□□ 1.25
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