RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CYP2J2P51589 502 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CAPN12Q6ZSI9 719 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ECSITQ9BQ95 431 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.73■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PPM1 405 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ABHD2P08910 425 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CFAP157Q5JU67 520 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 STKLD1Q8NE28 680 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 GRK7Q8WTQ7 553 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SLC5A5Q92911 643 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FAM161BQ96MY7 647 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 OLFM3Q96PB7 478 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 FNBP1Q96RU3 617 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DCLK3Q9C098 648 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 STK32BQ9NY57 414 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TYROBPO43914 113 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PGM1P36871 562 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB16Q05516 673 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DEUP1Q05D60 604 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DLGAP5Q15398 846 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RINT1Q6NUQ1 792 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 NAT14Q8WUY8 206 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SAYSD1Q9NPB0 183 aa17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ADRA1DP25100 572 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MAN1A1P33908 653 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 BPIFB4P59827 614 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CEP128Q6ZU80 1094 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SPATA24Q86W54 205 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 MYCT1Q8N699 235 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CFAP57Q96MR6 1250 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TUBB6Q9BUF5 446 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PLVAPQ9BX97 442 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 BLOC1S6Q9UL45 172 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 A8MXQ7 604 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V1G1O75348 118 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 BCRP11274 1271 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ANPEPP15144 967 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CPA2P48052 419 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 CDC16Q13042 620 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TTC7BQ86TV6 843 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 RELL1Q8IUW5 271 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ZNF653Q96CK0 615 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 ACP6Q9NPH0 428 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 TMX2Q9Y320 296 aa17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
GDE1-201ENST00000353258 SLITRK3O94933 977 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 FAM13AO94988 1023 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 POLR2MP0CAP2 368 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PLS3P13797 630 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CCDC62Q6P9F0 684 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MIPOL1Q8TD10 442 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TTC25Q96NG3 672 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SENP1Q9P0U3 644 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PFDN1O60925 122 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ZBED4O75132 1171 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 USP1O94782 785 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CYTH2Q99418 400 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TMEM165Q9HC07 324 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 NDE1Q9NXR1 346 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SGPL1O95470 568 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ASLP04424 464 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CYP3A4P08684 503 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ARP10275 920 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RARBP10826 455 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 VAV1P15498 845 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TTC1Q99614 292 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MKNK1Q9BUB5 465 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TRIM55Q9BYV6 548 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MIS12Q9H081 205 aa17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PIK3CDO00329 1044 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 GAS7O60861 476 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 OPHN1O60890 802 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms