RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 RAD23BP54727 409 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 EFHC2Q5JST6 749 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CEP170P1Q96L14 293 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TMEM150BA6NC51 233 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DGAT1O75907 488 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TPBGLP0DKB5 382 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TSHRP16473 764 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ATP6V1C1P21283 382 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MARK3P27448 753 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LIG4P49917 911 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PGM5Q15124 567 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZFATQ9P243 1243 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.6□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ASNSP08243 561 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPDYE6P0CI01 402 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DSG3P32926 999 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ARL4CP56559 192 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 HIF1AQ16665 826 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ANO5Q75V66 913 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NLRX1Q86UT6 975 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CYLDQ9NQC7 956 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 A6NHS1 94 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC22O60826 627 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CALCAP01258 141 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ACADSP16219 412 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCK1P35558 622 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GRIK3Q13003 919 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLC1A5Q15758 541 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KAZNQ674X7 775 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TMEM270Q6UE05 265 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TTC13Q8NBP0 860 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 BSNDQ8WZ55 320 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZNF516Q92618 1163 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 VPS11Q9H270 941 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 STOML1Q9UBI4 398 aa14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MAFGO15525 162 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CCNE2O96020 404 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 T-ENOLP0DO92 83 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 RXRBP28702 533 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 DLGAP5Q15398 846 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 PASD1Q8IV76 773 aa14.58□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms