RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN11Q5T124 520 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 IFT20Q8IY31 132 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PARVAQ9NVD7 372 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 AMACRQ9UHK6 382 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SCINQ9Y6U3 715 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TRADDQ15628 312 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 RNF39Q9H2S5 420 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SPC25Q9HBM1 224 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 KLK14Q9P0G3 267 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PROSCO94903 275 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ELNP15502 786 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 RWDD2BP57060 319 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 RNF186Q9NXI6 227 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CNTN3Q9P232 1028 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CEP83Q9Y592 693 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CALB1P05937 261 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF8P28908 595 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SLC1A1P43005 524 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 FAM228AQ86W67 206 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 IFT81Q8WYA0 676 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 WNT8BQ93098 351 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.16■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 MED7O43513 233 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS4O75173 837 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ERICH1Q86X53 443 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ST7Q9NRC1 585 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 NDST1P52848 882 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SP3Q02447 781 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1EQ12965 1108 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 BEST2Q8NFU1 509 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PARP2Q9UGN5 583 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TRIP11Q15643 1979 aa24.14■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 INCA1Q0VD86 236 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CAPNS2Q96L46 248 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 LHX5Q9H2C1 402 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 NFU1Q9UMS0 254 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 O00370 1275 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CLUL1Q15846 466 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 IPPQ9Y573 584 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TTI1O43156 1089 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 LLGL1Q15334 1064 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 DPH6Q7L8W6 267 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 MCEEQ96PE7 176 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 USTQ9Y2C2 406 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 MICAL2O94851 1124 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 ASGR1P07306 291 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 NKX3-2P78367 333 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM4-201ENST00000298454 CTSHP09668 335 aa24.12■■□□□ 1.45
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