RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 USP33Q8TEY7 942 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 HASPINQ8TF76 798 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBBXA8MT70 800 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 OGTO15294 1046 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 KCNN4O15554 427 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 GPC4O75487 556 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PPATQ06203 517 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CUL2Q13617 745 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PLCB4Q15147 1175 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 C4orf19Q8IY42 314 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 H3BRB1 525 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RARGP13631 454 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC12A3P55017 1021 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TSPY1Q01534 308 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 DCAF6Q58WW2 860 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 POTEAQ6S8J7 498 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RBP3P10745 1247 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 RFC5P40937 340 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 EPHB1P54762 984 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 IQCKQ8N0W5 287 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 HIPK4Q8NE63 616 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 MKL1Q969V6 931 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40-201ENST00000285243 CES2O00748 559 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 MAGEB2O15479 319 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 OPHN1O60890 802 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 NOD2Q9HC29 1040 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 P4HA2O15460 535 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TMPRSS15P98073 1019 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GJB1P08034 283 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FNTAP49354 379 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 DGKDQ16760 1214 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 RIPK3Q9Y572 518 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PDHA1P08559 390 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TNFRSF8P28908 595 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 APPL2Q8NEU8 664 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ERP27Q96DN0 273 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ASPHQ12797 758 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TTC13Q8NBP0 860 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CFAP69A5D8W1 941 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 B3GAT3O94766 335 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 HAUS5O94927 633 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 RAD23BP54727 409 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ROR1Q01973 937 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 LAMC2Q13753 1193 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SPATA18Q8TC71 538 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 BHMTQ93088 406 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GANQ9H2C0 597 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 COPEO14579 308 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TLR2O60603 784 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SERPINB6P35237 376 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PPP3CAQ08209 521 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 AGPSO00116 658 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 KRT37O76014 449 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CDR2Q01850 454 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC5A5Q92911 643 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms