RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 GNA15P30679 374 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SFNP31947 248 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CLDN10P78369 228 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 GRIK3Q13003 919 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 HHATQ5VTY9 493 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CCDC125Q86Z20 511 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CPXCR1Q8N123 301 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 FAM151AQ8WW52 585 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 BICD1Q96G01 975 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PTPRJQ12913 1337 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 A6NHS1 94 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TJP3O95049 919 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 VNN1O95497 513 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CETN2P41208 172 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PIK3CAP42336 1068 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TMEM270Q6UE05 265 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NLRX1Q86UT6 975 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TTC8Q8TAM2 541 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CEP170P1Q96L14 293 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.75■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CNTNAP1P78357 1384 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 BANF1O75531 89 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 KRT1P04264 644 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SPDYE6P0CI01 402 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TNNI1P19237 187 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 GCKP35557 465 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RASSF2P50749 326 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 KRT76Q01546 638 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CUL2Q13617 745 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PSMD6Q15008 389 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RASA2Q15283 850 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 MAPK6Q16659 721 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PARVAQ9NVD7 372 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 YDJCA8MPS7 323 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 C2CD2LO14523 706 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 EXTL3O43909 919 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 KRT4P19013 534 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 GPX6P59796 221 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CENPUQ71F23 418 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 HAUS1Q96CS2 278 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 FNBP1Q96RU3 617 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NPHS2Q9NP85 383 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.74■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ZNF862O60290 1169 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PTPN4P29074 926 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 EFHC2Q5JST6 749 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ANKMY2Q8IV38 441 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TEX9Q8N6V9 391 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 TLE6Q9H808 572 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 PPCSQ9HAB8 311 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 CLUHO75153 1309 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 ENTPD5O75356 428 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 STBD1O95210 358 aa15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
SYP-201ENST00000263233 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms