RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D2Q3 444 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrc1Q61830 1456 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttll6A4Q9E8 822 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc8D3YZV8 685 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spink5Q148R4 1017 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddr2Q62371 854 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspyl5Q69ZB3 406 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 WhrnQ80VW5 918 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp38Q8BW70 1042 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atg16l1Q8C0J2 607 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lcn6A2AJB9 181 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptpn11P35235 597 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grm6Q5NCH9 871 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DstykQ6XUX1 927 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr23Q7TRX4 325 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BGD0 127 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbx8Q9QXV1 362 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stat2Q9WVL2 923 aa13.45□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif6E9PX57 802 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxb8P09632 243 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup5P11591 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mxd4Q60948 209 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Celf4Q7TSY6 486 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcph1Q7TT79 822 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NrcamQ810U4 1256 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FsbpQ8BKE5 299 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Castor2Q8CAB8 329 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ftsj1Q8CBC7 324 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept8Q8CHH9 429 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asb7Q91ZU0 318 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pramef12Q9D2F1 463 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znhit2Q9QY66 399 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45208A0A140LJ36 292 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup10A2BIN1 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup14A2CEK7 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup19A9C497 187 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup15A9R9W0 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup17B5X0G2 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup8E9PVW0 235 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup7E9QA79 235 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sptlc1O35704 473 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup6P02762 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup1P11588 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup2P11589 180 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx1bP61264 288 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lig3P97386 1015 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sdr16c6Q05A13 316 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tdpoz3Q717B4 365 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3galnt2Q8BG28 504 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf2Q8C176 1104 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan4dA7KBS4 506 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtgisO35074 501 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan4fQ3URS2 506 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gngt2Q61017 69 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan4cQ80VJ6 506 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Baiap2l2Q80Y61 522 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gprc5aQ8BHL4 356 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim10Q9WUH5 489 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PfasQ5SUR0 1337 aa13.44□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itpripl1A2ASA8 547 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TnfP06804 235 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema5aQ62217 1077 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas2r125Q7M710 311 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SugctQ7TNE1 436 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Svs3bQ8BZH8 265 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MafaQ8CF90 359 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pard3bQ9CSB4 1203 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Armc9Q9D2I5 817 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jag1Q9QXX0 1218 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r1O70410 912 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rfc1P35601 1131 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GlrbP48168 496 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grm2Q14BI2 872 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo39Q5NBU5 443 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A1cfQ5YD48 595 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccnt2Q7TQK0 723 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr698Q7TRN4 311 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem220Q8BP07 167 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HpdlQ8K248 371 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc3Q8R173 299 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx2Q9CWK8 519 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc46Q9DAP0 323 aa13.43□□□□□ -0.26
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk4Q9JI11 487 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.2 ms