RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CEP120	Q8N960	986 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MSC	O60682	206 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TTC4	O95801	387 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RFC5	P40937	340 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PSMC4	P43686	418 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TOM1L1	O75674	476 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MMP8	P22894	467 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MAN1A1	P33908	653 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TRPC3	Q13507	836 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NEDD9	Q14511	834 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CCNG2	Q16589	344 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DNM1L	O00429	736 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KRT1	P04264	644 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PRKCB	P05771	671 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ETS1	P14921	441 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ORC1	Q13415	861 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	P3H1	Q32P28	736 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALT5	O43286	388 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	FSBP	O95073	299 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KRT19	P08727	400 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	OGDH	Q02218	1023 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK6	Q16659	721 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IRF6	O14896	467 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	FAM189A1	O60320	539 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CD19	P15391	556 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CNGA2	Q16280	664 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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