RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 VPS33BQ9H267 617 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 GOLGA8RI6L899 631 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 GH1P01241 217 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 CHN1P15882 459 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 BEX3Q00994 111 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 GPS1Q13098 491 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 KRT81Q14533 505 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 ARMCX2Q7L311 632 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 TAF12Q16514 161 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 KCNT1Q5JUK3 1230 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 MORC4Q8TE76 937 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 ALG3Q92685 438 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 PWWP2AQ96N64 755 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 MCEEQ96PE7 176 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 NUF2Q9BZD4 464 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-222ENST00000621217 FZD9O00144 591 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PODXLO00592 558 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PIAS1O75925 651 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CYP2C9P11712 490 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 FECHP22830 423 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 HOXD13P35453 343 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TNFAIP2Q03169 654 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 OSMRQ99650 979 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 H3BRB1 525 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 MAP3K7O43318 606 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 EDIL3O43854 480 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PHF2O75151 1096 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 BRAFP15056 766 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 KCNA4P22459 653 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ADORA2BP29275 332 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ERFP50548 548 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PACS2Q86VP3 889 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 KCTD6Q8NC69 237 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 AGPSO00116 658 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ZNF862O60290 1169 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PDHA1P08559 390 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 GTF2H1P32780 548 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 MAPK7Q13164 816 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 PLCB4Q15147 1175 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 HYIQ5T013 277 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TEPSINQ96N21 525 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 GINM1Q9NU53 330 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 STOML1Q9UBI4 398 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 HES2Q9Y543 173 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RASA4BC9J798 803 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RASA4O43374 803 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 CA4P22748 312 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 RAP1GAPP47736 663 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 METTL7BQ6UX53 244 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 UBA3Q8TBC4 463 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 FGD4Q96M96 766 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms