RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KIF22	Q14807	665 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	EDA	Q92838	391 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123		E9PLN8	166 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MYO1F	O00160	1098 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KPNA5	O15131	536 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF185	O15231	689 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FRS3	O43559	492 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FAM20B	O75063	409 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	UNC5C	O95185	931 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ANXA1	P04083	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	GCSH	P23434	173 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	APIP	Q96GX9	242 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TBCB	Q99426	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	XDH	P47989	1333 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	VPS4B	O75351	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KIF20A	O95235	890 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CKB	P12277	381 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CHRM3	P20309	590 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FGFR4	P22455	802 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ACRV1	P26436	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	INHBE	P58166	350 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	HSD11B2	P80365	405 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	DPT	Q07507	201 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CNGA2	Q16280	664 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	USP37	Q86T82	979 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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