RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.31■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 METTL23Q86XA0 190 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH10P35580 1976 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM49CP0CI26 452 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PTMSP20962 102 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB33AQ14088 237 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ZACNQ401N2 412 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PALB2Q86YC2 1186 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 BORCS6Q96GS4 357 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAM12O43184 909 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D4O60343 1298 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 STX10O60499 249 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 HUS1O60921 280 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 STX17P56962 302 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP12P59046 1061 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 CLUL1Q15846 466 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 OR6C75A6NL08 312 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 CLSTN1O94985 981 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 CPB1P15086 417 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ATICP31939 592 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 GTF2H1P32780 548 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ROR1Q01973 937 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 LIN9Q5TKA1 542 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 LILRA6Q6PI73 481 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SV2AQ7L0J3 742 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA18Q8TC71 538 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ASB2Q96Q27 587 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3CAP42336 1068 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 GCLMP48507 274 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNQ1P51787 676 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ARPP19P56211 112 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MYL6P60660 151 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TNNC1P63316 161 aa20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF699Q32M78 642 aa20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTA-208ENST00000558954 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 L1RE1Q9UN81 338 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 NCOR1O75376 2440 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR27A2RRH5 827 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 VNN1O95497 513 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31D3P0C874 917 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 MXI1P50539 228 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT39Q6A163 491 aa20.26■□□□□ 0.83
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