RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553238.5

SLC8B1-216, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 5

Gene SLC8B1, Length 1,675 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-216ENST00000553238 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 PGBD4Q96DM1 585 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 CILPO75339 1184 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 EOMESO95936 686 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 CXCL10P02778 98 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 P4HA1P13674 534 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 CD58P19256 250 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 TAF3Q5VWG9 929 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 WDR24Q96S15 920 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 RSAD1Q9HA92 442 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 TBX21Q9UL17 535 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 TTC3P53804 2025 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 SPTLC1O15269 473 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 KIF5CO60282 957 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 THP07101 528 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 H2AFZP0C0S5 128 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 GNA15P30679 374 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 PNPLA4P41247 253 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 RAP1GAPP47736 663 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 H2AFVQ71UI9 128 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 HIPK3Q9H422 1215 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC8B1-216ENST00000553238 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 RTN2O75298 545 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 PAEPP09466 180 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SCNN1GP51170 649 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 RAD23BP54727 409 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 GALCP54803 685 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 GNG11P61952 73 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TCTN1Q2MV58 587 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TTC39CQ8N584 583 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF560Q96MR9 790 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TWNKQ96RR1 684 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 KPNA7A9QM74 516 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ENPP3O14638 875 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 CLSTN1O94985 981 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 CFHP08603 1231 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TMEM253P0C7T8 217 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 LILRA4P59901 499 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TNNC1P63316 161 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 KIF18AQ8NI77 898 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TFAP2BQ92481 460 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 APBB2Q92870 758 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 VWCEQ96DN2 955 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 DNAI1Q9UI46 699 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ANKRD62A6NC57 917 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TACC1O75410 805 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TAF6P49848 677 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 GRIK3Q13003 919 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TCEAL1Q15170 157 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF394Q53GI3 561 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SLC35F6Q8N357 371 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SEPT8Q92599 483 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 SCLYQ96I15 445 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC8B1-216ENST00000553238 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms