RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPC4	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	APOL1	O14791	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DAPK3	O43293	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TLR5	O60602	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGCR	P04035	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CD53	P19397	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CRHR1	P34998	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TEC	P42680	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA7	P48741	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK10	P53779	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT3A	P56704	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ELF2	Q15723	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MAML1	Q92585	1016 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GAST	P01350	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CD1A	P06126	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SBK3	P0C264	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAP1	Q15027	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CCT6B	Q92526	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	EDA	Q92838	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CUL7	Q14999	1698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MATN4	O95460	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	COMT	P21964	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN7	P35236	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MRE11	P49959	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SOX8	P57073	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ICA1	Q05084	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BIRC3	Q13489	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FHL2	Q14192	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ALF	Q53S48	1182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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