RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAV3Q9UKW4 847 aa11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL26Q9Y258 94 aa11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.19□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAQ8IWI9 3026 aa11.18□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.18□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM149AA5PLN7 773 aa11.18□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC37A4O43826 429 aa11.18□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VNN2O95498 520 aa11.18□□□□□ -0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJA4P35212 333 aa11.18□□□□□ -0.62
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