RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530449.1

TCIRG1-211, Transcript of T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCIRG1, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1-211ENST00000530449 KCNA1Q09470 495 aa23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 MYBPC2Q14324 1141 aa23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ASB16Q96NS5 453 aa23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CFAP54Q96N23 3096 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 A0A087X0B3 334 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 STX6O43752 255 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 DUSP4Q13115 394 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PLD1Q13393 1074 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 POSTNQ15063 836 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TMEM209Q96SK2 561 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ZFP14Q9HCL3 533 aa23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 MTMR11A4FU01 709 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CYP11A1P05108 521 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 GJA1P17302 382 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 STAT6P42226 847 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CENPPQ6IPU0 288 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ACCSQ96QU6 501 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 LRRC3Q9BY71 257 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PANK2Q9BZ23 570 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 DPP3Q9NY33 737 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TCHHQ07283 1943 aa23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 GCNT3O95395 438 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 IDEP14735 1019 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CD72P21854 359 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CASP5P51878 434 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 GRM2Q14416 872 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TPRG1Q6ZUI0 275 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TMC8Q8IU68 726 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 SMARCD2Q92925 531 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 LTB4R2Q9NPC1 389 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 F5P12259 2224 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 IL18RAPO95256 599 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ALDH1A3P47895 512 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TAF6P49848 677 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 EPHB3P54753 998 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TEAD2Q15562 447 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 DNASE1L2Q92874 299 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 DSEQ9UL01 958 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 FANCMQ8IYD8 2048 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 FAM170BA6NMN3 283 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 CYB561D2O14569 222 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 WNT7BP56706 349 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 STK38Q15208 465 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 VITQ6UXI7 678 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PDILTQ8N807 584 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 BCO2Q9BYV7 579 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 BRD9Q9H8M2 597 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PANK4Q9NVE7 773 aa23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1-211ENST00000530449 PATJQ8NI35 1801 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 SOAT2O75908 522 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 SP9P0CG40 484 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 VIPR2P41587 438 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 ALCAMQ13740 583 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 SAAL1Q96ER3 474 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 BORCS6Q96GS4 357 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 GPR88Q9GZN0 384 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 ASB3Q9Y575 518 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 R4GN57 208 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 COL4A2P08572 1712 aa23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 NCANO14594 1321 aa23.38■■□□□ 1.33
TCIRG1-211ENST00000530449 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms