RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 JADE3Q92613 823 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 HAPLN3Q96S86 360 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SMOQ99835 787 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 KLC4Q9NSK0 619 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 WDR27A2RRH5 827 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 C5AR1P21730 350 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ITPKBP27987 946 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 NPTX2P47972 431 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TLE1Q04724 770 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 DPF1Q92782 380 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TRIB1Q96RU8 372 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 IPPQ9Y573 584 aa6.45□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TTLL1O95922 423 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CELA2AP08217 269 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ITGB6P18564 788 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 INAVAQ3KP66 663 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 DDB2Q92466 427 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 PBKQ96KB5 322 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ZNF778Q96MU6 729 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.44□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 IL10RAQ13651 578 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ALG8Q9BVK2 526 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 AOX1Q06278 1338 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.43□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 A0A0B4J269 797 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 WDR91A4D1P6 747 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 KLHL33A6NCF5 533 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CCDC154A6NI56 674 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 VWC2LB2RUY7 222 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 MT-CO1P00395 513 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TUBB3Q13509 450 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 PDSS2Q86YH6 399 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 POC1BQ8TC44 478 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 PADI4Q9UM07 663 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.42□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 LINC01548A6NM66 108 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 E9PLN8 166 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 F5H697 171 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TRIAP1O43715 76 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 EDNRBP24530 442 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 LLGL1Q15334 1064 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 KAT5Q92993 513 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SCAMP4Q969E2 229 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 RHOP08100 348 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 GNAI3P08754 354 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 NDUFV1P49821 464 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 GNAI1P63096 354 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CCDC93Q567U6 631 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 FBXO41Q8TF61 875 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 RLIMQ9NVW2 624 aa6.4□□□□□ -1.38
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