RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF14	Q92915	247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP72	Q9P209	647 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE4B	O95155	1302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRRG1	O14668	218 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOSPD3	O75425	235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ODC1	P11926	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPR3	P17342	541 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAX3	P23760	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF6	P49848	677 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT85	P78386	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR17	Q13304	367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYB561D2	O14569	222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRG1	P02750	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGB3	P05106	788 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPB1	P15086	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEBPB	P17676	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELF1	P32519	619 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G5	P39877	138 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFA8	P51970	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHA5	P54756	1037 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TWF1	Q12792	350 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK4	Q13043	487 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP4	Q13115	394 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP37	Q86T82	979 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLIC2	O15247	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN2	P17706	415 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	AVPR2	P30518	371 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQ27	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQ64	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQD8	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOAT2	O75908	522 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRF	P11831	508 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCAR	P24071	287 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDR1	P51861	262 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCF15	Q12870	199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SV2C	Q496J9	727 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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