RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCNN1G	P51170	649 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	EPHB1	P54762	984 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRT40	Q6A162	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q6ZRM9	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HAS1	Q92839	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439		H0YGN5	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAB27A	P51159	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAM8	P78325	824 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MALL	Q13021	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NOG	Q13253	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACAP2	Q15057	778 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACE	P12821	1306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCN4A	P35499	1836 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NUP155	O75694	1391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MTSS1	O43312	755 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	AKAP10	O43572	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NDUFS2	O75306	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TOX4	O94842	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABLIM3	O94929	683 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	C5AR1	P21730	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CTSS	P25774	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	MCAM	P43121	646 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACAP1	Q15027	740 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	GREM2	Q9H772	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	POGK	Q9P215	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	XDH	P47989	1333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439		A0A1W2PPC1	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	EPHX2	P34913	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NPEPPS	P55786	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	WNT3A	P56704	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOPBP1-208	ENST00000511439	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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