RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 VPS16Q9H269 839 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 LGALS16A8MUM7 142 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 RFXAPO00287 272 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 LRRN2O75325 713 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 OAZ2O95190 189 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 URODP06132 367 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 P4HA1P13674 534 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 TNNC1P63316 161 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 PTPN14Q15678 1187 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 WDR44Q5JSH3 913 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 GBP6Q6ZN66 633 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 RNF214Q8ND24 703 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 TCF25Q9BQ70 676 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTN3-202ENST00000511191 HUS1O60921 280 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TACC1O75410 805 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TMC7Q7Z402 723 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 B3GALT6Q96L58 329 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 BCO2Q9BYV7 579 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 GCNT4Q9P109 453 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 L1RE1Q9UN81 338 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 A0A1B0GTH6 734 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TBC1D4O60343 1298 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ASPAP45381 313 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 CREMQ03060 361 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 WSCD1Q658N2 575 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 CEP57Q86XR8 500 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 RBSNQ9H1K0 784 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 FNIP2Q9P278 1114 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 MTRRQ9UBK8 725 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 POLIQ9UNA4 740 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 VWA8A3KMH1 1905 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 H7C4K7 107 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 GABRDO14764 452 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 PON1P27169 355 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 IRS1P35568 1242 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 FANCCQ00597 558 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 METTL23Q86XA0 190 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 NT5C1BQ96P26 610 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TSC2P49815 1807 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 CXCL14O95715 111 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 LHX1P48742 406 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 KCNMA1Q12791 1236 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 PSMD5Q16401 504 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF280DQ6N043 979 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TATDN2Q93075 761 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 MMS19Q96T76 1030 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 SERPINC1P01008 464 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 SLC9A1P19634 815 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 GCNT1Q02742 428 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 ADGRE1Q14246 886 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 Q7L0L9 218 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTN3-202ENST00000511191 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms