RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHB3P54753 998 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MCM6Q14566 821 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 NELL1Q92832 810 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 E2F7Q96AV8 911 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 FIZ1Q96SL8 496 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ODC1P11926 461 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GDI1P31150 447 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 LILRA4P59901 499 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF2BQ00403 316 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 DUSP4Q13115 394 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TEAD2Q15562 447 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 JADE1Q6IE81 842 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TMC8Q8IU68 726 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MFSD6LQ8IWD5 586 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB44Q8NCP5 570 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 IER2Q9BTL4 223 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC3Q9BY71 257 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 DERAQ9Y315 318 aa24.47■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PPEF2O14830 753 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GJA1P17302 382 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 VIPR2P41587 438 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH1A3P47895 512 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CENPPQ6IPU0 288 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SENP8Q96LD8 212 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 HSFX1Q9UBD0 423 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ASB3Q9Y575 518 aa24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MTMR11A4FU01 709 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIN1Q05586 938 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 MAMSTRQ6ZN01 415 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM212AQ96EL1 285 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CHRDQ9H2X0 955 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ASB7Q9H672 318 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.45■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF263O14978 683 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 LILRB5O75023 590 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP11A1P05108 521 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 MTAPQ13126 283 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 RMDN1Q96DB5 314 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 C2CD2Q9Y426 696 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NCANO14594 1321 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTBN2O15020 2390 aa24.44■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1W2PRU2 124 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ANO9A1A5B4 782 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ARNTLO00327 626 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 PIRO00625 290 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 FGF19O95750 216 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NFICP08651 508 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 DCLK2Q8N568 766 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM3CQ92520 227 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMG2Q969U7 264 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 MSANTD3Q96H12 275 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 EPC1Q9H2F5 836 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NCOR2Q9Y618 2525 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 OBSL1O75147 1896 aa24.43■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 DDIT3P35638 169 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 DSEQ9UL01 958 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CHADO15335 359 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ACOT2P49753 483 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.42■■□□□ 1.5
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP2R5DQ14738 602 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms