RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPA4Q9UI42 421 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLTPD2A6NH11 291 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD6Q15008 389 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PWWP2AQ96N64 755 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.48■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPP9Q86TI2 863 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KAT6AQ92794 2004 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P4HA2O15460 535 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNA15P30679 374 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK6Q16659 721 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf91Q3C1V1 193 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC114Q96M63 670 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN18Q99952 460 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRAGCQ9HB90 399 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIP11Q15643 1979 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A6NNZ2 444 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHN1P15882 459 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGIRP43119 386 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CUL2Q13617 745 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC14Q15048 493 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLC4Q9NSK0 619 aa16.47■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENO4A6NNW6 628 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPFIA2O75334 1257 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX5P50542 639 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR25O00155 361 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A27O95847 323 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK4P31152 587 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNTAP49354 379 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LONRF1Q17RB8 773 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HES2Q9Y543 173 aa16.46■□□□□ 0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC3O43617 180 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGALS2P05162 132 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFICP08651 508 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNA3P32297 505 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2H1P32780 548 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP1Q07960 439 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL4Q14679 1199 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGO2Q562F6 1265 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HVCN1Q96D96 273 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHST7Q9NS84 486 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGT7Q9UJ14 662 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL33A6NCF5 533 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF3CO14782 793 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFX1P22670 979 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RWDD2BP57060 319 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTP1P59025 263 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIZQ2M2Z5 673 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC14L1Q92503 715 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.45■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms