RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.78□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
MITF-215ENST00000478490 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NOTCH4Q99466 2003 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQJ5 194 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PRKCBP05771 671 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CTSAP10619 480 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MUTP22033 750 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KLRC2P26717 231 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RPA1P27694 616 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 AXLP30530 894 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KRT9P35527 623 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KRT83P78385 493 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KCNK18Q7Z418 384 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MNS1Q8NEH6 495 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SUSD6Q92537 303 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CASP10Q92851 521 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PNMA5Q96PV4 448 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 VPS16Q9H269 839 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 POMKQ9H5K3 350 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SNTG2Q9NY99 539 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 USP34Q70CQ2 3546 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.77□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 FAM187AA6NFU0 413 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MYMKA6NI61 221 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CCDC169A6NNP5 214 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SFI1A8K8P3 1242 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 JUNDP17535 347 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CYP11B2P19099 503 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 GNG11P61952 73 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CDK17Q00537 523 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 EHHADHQ08426 723 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 STK4Q13043 487 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MCM6Q14566 821 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MAN2A1Q16706 1144 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PKDCCQ504Y2 493 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RETREG3Q86VR2 466 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PALB2Q86YC2 1186 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DEPTORQ8TB45 409 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 FAM122AQ96E09 287 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CEP63Q96MT8 703 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DNAJC7Q99615 494 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 A0A1B0GUA9 196 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PRR33A8MZF0 331 aa6.76□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.76□□□□□ -1.33
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