RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CEBPB	P17676	345 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PNPLA4	P41247	253 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	GPC5	P78333	572 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	STK38	Q15208	465 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	USP37	Q86T82	979 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FRYL	O94915	3013 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EXTL3	O43909	919 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CPB1	P15086	417 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MAGEA9	P43362	315 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TAF6	P49848	677 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TWF1	Q12792	350 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307		H0Y858	1186 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	GCNT3	O95395	438 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FGF19	O95750	216 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	F13A1	P00488	732 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	HOXD13	P35453	343 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ARPP19	P56211	112 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	WNT7B	P56706	349 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	AMPD3	Q01432	767 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	UBE4B	O95155	1302 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	COL4A2	P08572	1712 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PGAP2-215	ENST00000469307	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PGAP2-215	ENST00000469307	ARNTL	O00327	626 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PGAP2-215	ENST00000469307	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PGAP2-215	ENST00000469307	DUSP4	Q13115	394 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PGAP2-215	ENST00000469307	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PGAP2-215	ENST00000469307	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.33	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms