RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 TBKBP1A7MCY6 615 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 DGKIO75912 1065 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 AMHP03971 560 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 HCSTQ9UBK5 93 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 FGBP02675 491 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CCDC172P0C7W6 258 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 ZNF132P52740 706 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SYT11Q9BT88 431 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 F8W810 466 aa25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CALCAP01258 141 aa25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 DPF3Q92784 378 aa25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CCDC42Q96M95 316 aa25.92■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 B3GAT3O94766 335 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 ZNF394Q53GI3 561 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 TMEM240Q5SV17 173 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 WHAMMQ8TF30 809 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.742e-7■■■□□ 15.1
NME4-209ENST00000460297 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CILPO75339 1184 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 KIF4AO95239 1232 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 NDUFA10O95299 355 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 ITGB1P05556 798 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CYP11B1P15538 503 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 INCA1Q0VD86 236 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 HASPINQ8TF76 798 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SENP8Q96LD8 212 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 L1RE1Q9UN81 338 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 KIF11P52732 1056 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 TWNKQ96RR1 684 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 DESI2Q9BSY9 194 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.9■■□□□ 1.74
NME4-209ENST00000460297 CYB561D2O14569 222 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 OR1G1P47890 313 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 KCNJ6P48051 423 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 LRRC43Q8N309 656 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 APPL2Q8NEU8 664 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 DEF6Q9H4E7 631 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 NME7Q9Y5B8 376 aa25.89■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 ZBBXA8MT70 800 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 ZNF263O14978 683 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 HUS1O60921 280 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 TACC1O75410 805 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 BRCC3P46736 316 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 NDST1P52848 882 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 RAD23BP54727 409 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 DPH6Q7L8W6 267 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 A0A087X0T9 212 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 I3L4J1 428 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 AKR1B10O60218 316 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 FAM228BP0C875 321 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 CHRNB2P17787 502 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 PDE6CP51160 858 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 BPIFB4P59827 614 aa25.87■■□□□ 1.73
NME4-209ENST00000460297 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms