RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PTK7Q13308 1070 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 EMC2Q15006 297 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SPATS1Q496A3 300 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF879B4DU55 563 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SNAP23O00161 211 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TRAF5O00463 557 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA7O14818 248 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CLOCKO15516 846 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NCK2O43639 380 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL2O95198 593 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA2P25787 234 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CYP4A11Q02928 519 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 BARGINQ6ZT62 677 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 STOX1Q6ZVD7 989 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 S100ZQ8WXG8 99 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CCT6BQ92526 530 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TCF12Q99081 682 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MXD3Q9BW11 206 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC2Q9BYS8 371 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SPASTQ9UBP0 616 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 FPGTO14772 594 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 UFL1O94874 794 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GNA14O95837 355 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 AGR2O95994 175 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 AGTP01019 485 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NTRK1P04629 796 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 CKBP12277 381 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 IFI30P13284 250 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ALOX12P18054 663 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NPR2P20594 1047 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 G0S2P27469 103 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 GPR85P60893 370 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PDK3Q15120 406 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 KYNUQ16719 465 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CENPUQ71F23 418 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 KRT77Q7Z794 578 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA18Q8TC71 538 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MYDGFQ969H8 173 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 APOL4Q9BPW4 351 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ERP44Q9BS26 406 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 AZI2Q9H6S1 392 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR6Q9Y217 621 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CFL2Q9Y281 166 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CYP27B1O15528 508 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJB5O75953 348 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HMGN1P05114 100 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CTNNB1P35222 781 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GPSM2P81274 684 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CD83Q01151 205 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PRKCEQ02156 737 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NCAPHQ15003 741 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SLC15A2Q16348 729 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MOGQ16653 247 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SSX9Q7RTT3 188 aa5.84□□□□□ -1.47
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