RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439027.1

AC011228.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC011228.1, Length 757 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC011228.1-201ENST00000439027 PFKPQ01813 784 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SPAG1Q07617 926 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 UBXN2BQ14CS0 331 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CAMK4Q16566 473 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 RRAGBQ5VZM2 374 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 C1orf210Q8IVY1 113 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 IQUBQ8NA54 791 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 APPL2Q8NEU8 664 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 PJA1Q8NG27 643 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 DHX58Q96C10 678 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 BCO2Q9BYV7 579 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 GDE1Q9NZC3 331 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CNTN3Q9P232 1028 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 FBXL5Q9UKA1 691 aa10□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CITO14578 2027 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SPTBN2O15020 2390 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 WDR27A2RRH5 827 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 FAM170BA6NMN3 283 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ABLIM3O94929 683 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SEC24AO95486 1093 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CLTAP09496 248 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SLFN14P0C7P3 912 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SP9P0CG40 484 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CXCL8P10145 99 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 GLULP15104 373 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CD72P21854 359 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 STAT6P42226 847 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC12A3P55017 1021 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 PRKCQQ04759 706 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 IQCEQ6IPM2 695 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF280DQ6N043 979 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ELMOD1Q8N336 334 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SUSD3Q96L08 255 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TIGD1Q96MW7 591 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 HINFPQ9BQA5 517 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 USP25Q9UHP3 1055 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 NOTCH4Q99466 2003 aa9.99□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 H0YCG3 227 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ZNF197O14709 1029 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 SLC26A4O43511 780 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TBC1D4O60343 1298 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ECI2O75521 394 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 FAM13AO94988 1023 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 MYL4P12829 197 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 CPB1P15086 417 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ATF2P15336 505 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 LIG4P49917 911 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 MCL1Q07820 350 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ADCY1Q08828 1119 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 HYIQ5T013 277 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TPGS2Q68CL5 300 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ZPBP2Q6X784 338 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 USP37Q86T82 979 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 GPBP1Q86WP2 473 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 MYCT1Q8N699 235 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 TNMDQ9H2S6 317 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.98□□□□□ -0.81
AC011228.1-201ENST00000439027 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms